Bylo nebylo, v malé vesničce žil desetiletý Tomáš, který miloval dobrodružství a tajemno. Jednoho dne obdržel zvláštní dopis s pozvánkou na cestu vlakem do Zázračného města, města, o kterém se říkalo, že je plné kouzel a zázraků. Tomáš, plný vzrušení, balil svůj batoh a připravoval se na cestu, která měla změnit jeho život.

Na nádraží našel starý, ale nádherně zdobený vlak, jehož každý vagón měl jinou barvu. Vlak vypadal jako z pohádky, a dokonce i strojvůdce měl na sobě zářivě modrý kabát a rozjasněný úsměv. Tomáš vystoupil na palubu, našel své místo a vlak začal pohádkovou jízdu.

Jakmile vlak vyjel z nádraží, začalo se dít něco neuvěřitelného. Okna vlaku se změnila v obrazovky, na kterých se objevovaly kouzelné krajiny. Tomáš viděl létající ostrovy, mluvící zvířata a dokonce i les plný tancujících stromů.

V jednom z vagónů se Tomáš setkal s Alenou, dívkou o něco starší než on, která cestovala do Zázračného města, aby našla lék pro svého nemocného bratra. Spřátelili se a rozhodli se, že budou spolu prozkoumávat tajemství vlaku.

Další zastávkou byla Cukrová hora, místo, kde všechno, co jste si jen mohli představit, bylo vyrobeno z cukru. Tomáš a Alena si vychutnávali cukrové jablka a sledovali, jak se cukr tvaruje do neuvěřitelných podob.

Vlak zastavil v Lešení lesa, kde stromy měly schopnost přemýšlet a mluvit. Tomáš a Alena pomáhali stromům vyřešit záhadu ztraceného pramene, který jim dával život. Za jejich pomoc byli odměněni magickými semínky, které mohly vyrůst kdekoliv.

Noční obloha nad vlakem se rozzářila tisíci hvězd a Tomáš s Alenou pozorovali, jak se obloha mění v živou mapu vesmíru. Vlak projížděl galaxiemi a nabízel pohled na vzdálené planety.

Náhle vlak zpomalil a zastavil u řeky Zapomenutých příběhů, kde voda nesla vzpomínky na všechny příběhy, které kdy byly vyprávěny. Tomáš a Alena poslouchali příběhy a učili se lekce od starých legend.

Dalším zastavením byl Oceán snů, kde se mohli cestující potápět do svých vlastních snů a želání. Tomáš a Alena prožili dobrodružství v labyrintu svých nejdivočejších fantazií.

Když se vlak blížil ke konci své cesty, Tomáš a Alena se zastavili v Zrcadlovém sále, kde každé zrcadlo ukázalo, jak by mohli vypadat jejich životy, pokud by si vybrali různé cesty.

Nakonec dorazili do Zázračného města, kde se skutečnost mísila s fantazií. Alena našla lék pro svého bratra a Tomáš se naučil, že každé dobrodružství, i když se zdá být jen snem, může mít hluboký význam.

Při cestě zpět domů se Tomáš cítil moudřejší. Rozloučil se s Alenou a věděl, že přátelství, které spolu vytvořili, bude trvat věčně, stejně jako vzpomínky na jejich tajemnou cestu vlakem.

Tomáš se vrátil domů s hlavou plnou příběhů a srdcem plným dobrodružství. Věděl, že jednoho dne znovu vyrazí na cestu, protože vlak do Zázračného města jezdí vždy, když si někdo přeje pravé dobrodružství.